Substancja szara (istota szara, łac. substantia grisea) – skupisko ciał komórek nerwowych (neuronów) w ośrodkowym układzie nerwowym. Między innymi z uwagi na obecność ciałek Nissla (tigroidu), przybiera na przekroju nieutrwalonego preparatu barwę szaroróżową.
W ośrodkowym układzie nerwowym istota szara znajduje się na powierzchni – w mózgu i móżdżku, nosi tam nazwę kory (łac. cortex); oraz w głębi, otoczona istotą białą – tworzy jądra nerwowe (łac. nuclei nervosi).